El área de organización de la corporación Fasol se creó con el objetivo de estar en comunicación permanente con la población destinataria de las cinco regionales: Antioquia, Costa Caribe, Cundinamarca, Santanderes y Sur, convirtiéndose en el punto de articulación con las demás áreas programáticas. 

Es importante señalar que, además de desarrollar el componente organizativo, el área cuenta con dos líneas de trabajo: memoria y formación. Por una parte, desde el año 2019 se está trabajando en un proyecto de memoria, el cual se ha venido desarrollando por cada una de las regionales en diferentes ritmos. Este proyecto cuenta con tres etapas para su realización:

Por otra parte, se encuentra la línea de formación, la cual se propone establecer una relación de aprendizaje con las y los destinatarios en temas relacionados con el conflicto armado interno colombiano, derechos humanos y justicia transicional.